Endometrioza jest chorobą polegającą na występowaniu błony śluzowej macicy (endometrium) poza macicą. Najczęściej ogniska występują na jajnikach, na otrzewnej miednicy mniejszej oraz na innych strukturach w jamie brzusznej. Endometrioza jest chorobą przewlekłą, która u wielu pacjentek doprowadza do silnych dolegliwości bólowych w czasie miesiączki, współżycia, a u niektórych podczas całego cyklu. Niepłodność u kobiet z endometriozą może występować przy niewielkich ogniskach na otrzewnej miednicy mniejszej, u części chorych dochodzi do zrostów mogących powodować niedrożność jajowodów. Jedną z najcięższych postaci tej choroby jest powstanie torbieli jajników, które niszczą prawidłową strukturę jajników i znacznie zmniejszają rezerwę jajnikową. Leczenie niepłodności w przypadku endometriozy to przede wszystkim leczenie operacyjne polegające na usunięciu ognisk endometriozy, zrostów lub torbieli jajników. Zmniejszona rezerwa jajnikowa (obniżone stężenie AMH) oraz brak ciąży po leczeniu operacyjnym kwalifikuje chorą z endometriozą do wykonania zapłodnienia pozaustrojowego (InVitro).